Präzisionslandwirtschaft in Pflanzenbau und Tierhaltung

Titel

Innovative Monitoring- und Entkeimungsverfahren für die mikrobiologische Sicherheit in der Produktionskette frischer pflanzlicher Lebensmittel. Teilvorhaben: Gefahrenfrüherkennung auf Basis der produktionsübergreifenden Identifizierung pflanzenassoziierter Mikroorganismen.

Kürzel

SafeFresh

Beginn

01.10.2012

Ende

31.03.2015

Koordinierendes Institut

Fraunhofer-Institut für Verfahrenstechnik und Verpackung

Koordination

Ansprechpartner ATB

Partner

Zusammenfassung

Im Rahmen dieses Teilprojektes soll eine detaillierte Charakterisierung des mikrobiellen Besatzes auf der Oberfläche von Frischeprodukten während der Aufarbeitung erfolgen, um die Grundlage für eine Gefahrenfrüherkennung im Hinblick auf humanpathogene Bakterien zu erarbeiten. Die Ermittlung der pflanzenassoziierten Mikroorganismen soll in erster Linie durch deren Kultivierung auf Standard-Nährböden und nachfolgender Identifizierung auf Basis der Erfassung des Zellproteinspektrums mittels MALDI-TOF/MS Analyse erfolgen. Zur Identifizierung als unbekannt eingestufter Mikroorganismen soll eine Analyse der Nukleotidsequenz variabler Bereiche des rRNA Operons durchgeführt werden. Es ist zu erwarten, dass mittels eines kulturbasierten Ansatzes die mikrobielle Vielfalt nur in Teilen erfasst wird. Daher soll die Struktur der mikrobiellen Gemeinschaft ergänzend mit einem kultivierungsunabhängigen Verfahren bestimmt werden. Hierzu soll ebenfalls eine umfassende Analyse der Nukleotidsequenz des bakteriellen rrS-Gens erfolgen. Weiterhin soll in diesem Teilvorhaben die Entwicklung des mikrobiellen Besatzes während der gesamten Aufarbeitungskette betrachtet werden. Von besonderem Interesse sind hierbei das Auftreten und die Entwicklung von Modellkeimen als Indikator für die Populationsdynamik von pathogenen Kontaminanten. Hierbei sollen sowohl kultivierbare als auch nicht- oder schwer zu kultivierende Zielkeime betrachtet werden. Ziel dieses Teilvorhabens ist der Aufbau einer Datenbank mit Referenz-MALDI-TOF/MS-Spektren pflanzenassoziierter Mikroorganismen als Basis für eine schnelle kulturbasierte Diagnostik. Des Weiteren sollen Grundlagen zur Dynamik endemischer Mikroorganismen und eingetragener Kontaminanten erarbeitet werden. In diesem Zusammenhang soll insbesondere die Auswirkung von Hygienisierungsmassnahmen auf die mikrobielle Gemeinschaft betrachtet werden.

Förderung

Förderkennzeichen

Förderprogramm

Bekanntmachung "Sicherung der Lebensmittel und Lebensmittelwarenketten"